单细胞转录组产品
人基因组重测序可全面扫描人类基因组上的变异信息,一次性挖掘大量的生物标记物,该技术准确性高、可重复性好、定位精确,已被广泛应用于疾病、癌症的基因组研究。
10x Genomics单细胞转录组
利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,实现数千甚至数万个单细胞群体分析。
SeekOne DD单细胞转录组
利用SeekOne®DD微流控平台在单细胞水平上对 mRNA 进行高通量测序和分析,能获得单个细胞内基因表达信息,为辨别生物组织中各种细胞类型的转录组特征提供有力的工具。
10x Genomics单细胞基因表达Flex
不仅适配FFPE样本,还能够锁定新鲜样本的细胞状态,在不牺牲样本完整性或数据质量的情况下采集样本、运输到中心实验室并开展分析,打破了样本限制,释放各类样本的单细胞研究潜能。
10x Genomics单细胞V(D)J
在单细胞水平同时实现免疫组库分析(TCR和BCR)和5’端基因表达谱分析,在解析免疫组库多样性,探索T/B细胞特异性抗原,描述肿瘤微环境等研究中有广泛应用。
10x Genomics单细胞GEM-X
以Chromium X平台作为技术承载,推出单细胞基因表达(3’)v4版本和单细胞免疫组(5’)v3版本两款产品,对单细胞转录组和单细胞免疫组库各方面性能进行了全面升级。
单细胞全长转录组
可同时实现单细胞水平的基因表达定量和全长转录本可变剪切信息的获取,为探索疾病发生发展的分子机制提供强大的技术支撑。
10x Genomics单细胞ATAC/多组学
可以同时获得同一细胞的基因表达和染色质可及性图谱,提供同一细胞基因表达信息及其表观基因组景观的统一视图;识别差异基因表达的驱动因素,揭示调控元件、开放染色质和基因表达之间复杂的相互作用。
应用方向
- 组织图谱:绘制不同器官和组织的细胞图谱;有助于理解健康和疾病状态下的细胞组成和功能;
- 发育分化:监测发育不同阶段的细胞转录活动,对于理解组织发育和再生、以及干细胞科学至关重要;
- 肿瘤研究:识别和分类肿瘤内的异质细胞群体,包括癌细胞和肿瘤微环境中的其他细胞类型(如免疫细胞),有助于揭示肿瘤的发展、扩散机制以及对治疗的响应;
- 免疫研究:在单细胞层面上详细分析免疫细胞的状态和功能,识别不同的免疫细胞亚型和它们在免疫反应中的作用,对于开发针对感染、炎症以及自身免疫疾病的新疗法具有重要意义;
案例解析
人和小鼠HCC癌症相关成纤维细胞图谱
单细胞测序揭示癌相关成纤维细胞为肝细胞癌提供免疫抑制微环境
肝细胞癌(HCC)是一种具有高度细胞异质性的恶性肿瘤。该研究利用单细胞转录组测序技术分别对人和小鼠的肝细胞癌肿瘤免疫微环境进行高精度观测,在单细胞水平上系统全面地绘制了人和小鼠HCC癌症相关成纤维细胞(CAFs)图谱及亚群特征。并确定了CD36在CD36+CAFs中通过脂质过氧化/p38/CEBPs轴介导氧化性LDL摄取依赖的MIF表达,进而促进免疫抑制性肿瘤微环境的形成以及肿瘤细胞的扩增等。并且,作者通过一系列的验证,揭示靶向CD36可有效提高免疫治疗的疗效。该研究不仅深入地挖掘了肿瘤相关成纤维细胞关键亚型在促肿瘤过程中的分子机制,还为克服免疫抑制性肿瘤微环境、提高临床免疫治疗及细胞治疗疗效提供了坚实的数据支撑。
参考文献:Zhu G Q, Tang Z, Huang R. et al. CD36+ cancer-associated fibroblasts provide immunosuppressive microenvironment for hepatocellular carcinoma via secretion of macrophage migration inhibitory factor [J]. Cell Discovery. 2023 Mar 6;9(1):25.