贝全安®全外显子组检测

全面、快速、精准的产前全外单基因病诊断综合服务

贝全安全外显子组检测

产前超声异常胎儿,以往通常采用核型分析进行遗传病诊断,其诊断率为30%左右,而后续通过基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)等技术也仅提高了约6%的诊断率(Petrovski et al., 2019)。这意味着仍有许多其他超声异常的病例存在,且未检出的病例仅能依靠有限的信息进行遗传咨询,无疑使医生与准父母面临着巨大挑战。

2020年01月,ACMG发出胎儿外显子组检测技术在产前诊断中的临床应用意见(Monaghan K G et al., 2020) ,从应用场景、检测策略、报告周期、报告变异范围、检测前后的遗传咨询等多方面内容做了详细的阐述和指导建议。同年09月,为了规范、推进我国产前外显子组测序技术的临床应用,提升产前遗传咨询水平和质量,我国首个团体标准《产前外显子组测序遗传咨询和报告规范》相应出台。

适用人群

● 超声结构异常,单一或多系统

● NT增厚(≥3.0mm)

● 重度胎儿宫内生长发育受限(FGR,小于第10百分位数)、胎儿严重贫血

● 重度羊水过多(羊水最大暗区>15cm或羊水指数>45cm)、羊水过少(羊水最大暗区≤2cm或羊水指数≤5cm)、双侧脑室增宽(10-15mm)、脑积水/脑水肿,胎儿水肿等异常情况

● 多发流产,流产原因不明的流产组织, 为提高诊断效能,建议采用贝全安® + 科诺安® 联合检测

产品优势
分析全面

NanoWES探针覆盖约25,000个基因,明确致病调控元件及内含子区域,线粒体基因组等。结合CNV-seq,覆盖SNP、Indel、CNV、非整倍体、嵌合体、LOH/UPD等多种变异类型

周转时间(TAT)短

2-3周完成超声结构异常胎儿的全面遗传学诊断。 Trio-WES 变异位点家系成员验证,缩短报告周期(Sanger验证一致率>99.9%)

结果精准

PCR-free 预文库构建,探针1捕1捕获,数据均一性高 Trio-WES精准识别新发突变,可在一次检测中完成家系共分离分析

全流程高质量服务

Verita Trekker ®变异位点检测系统、Enliven®变异位点注释系统、Cruxome®数据分析系统和NLPearlTM智能数据挖掘为一体的WES大数据分析与管理平台体系。强大的信息分析、解读和遗传咨询团队,提供全链条高质量服务

案例分享
临床信息

孕妇,32岁,孕12周就诊,超声提示胎儿颈部透明层厚度(NT)5.7mm  

不良孕产史:

2018年妊娠12周+5天,超声提示NT值5.1mm 孕18周,经羊水产前诊断:染色体核型分析正常,CNV-seq未见明显异常; 孕24周,B超提示既往胎儿左颈后皮下可见一囊性包块,大小17×16×10mm,边界清晰,内透声尚可,考虑淋巴管瘤可能,胎儿双足呈内翻姿势; 孕28周,超声提示胎儿双顶径76mm,头围272mm,腹围235mm,股骨长52mm,颈后17×7mm液相暗区,胎儿双足内翻,羊水过多(羊水指数283mm); 孕32周,胎儿早产夭折(诊断重度窒息新生儿),具体病因不详。

检测结果

临床医生在了解了孕妇情况后,推测该孕妇NT增厚的情况与遗传因素相关的可能性较大。在通过沟通拿到前一胎的DNA标本后,临床医生便将其与孕妇夫妻二人的DNA样本一起进行了家系全外显子测序(WES)。根据检测报告显示,在前一胎的DNA样本中检测到其2号染色体NEB基因存在两个变异位点,一个来自父亲c.4255-c.4256的杂合缺失变异,一个来自母亲c.18366+2T>C的剪接位点变异,该基因变异与常染色体隐性遗传疾病线状体肌病2型(Nemaline myopathy 2, autosomal recessive)相关。根据ACMG指南及临床表型综合判定,该家庭早夭胎儿为线状体肌病2型患者。

 

为了进一步确定此次胎儿情况,临床医生将胎儿样本同步送检染色体核型分析、CNV-seq及WES。结果不出所料,此次胎儿与早夭胎儿一样,核型及CNV-seq未见异常,但出现了NEB基因c.4255_4256del(杂合)及c.18366+2T>C(杂合)突变。

 

在经过了临床医生的遗传咨询后,该孕妇选择终止妊娠。

 

案例点评

随检测技术不断进展,许多常见胎儿指标异常的病因不断打破我们的常规认识,NT增厚不再仅仅局限于三体综合征等染色体疾病,一些单基因遗传病也可能会出现类似的表型,临床可采用多种方法查明病因。

 

另外,NT增厚是要直接做测序,还是要等后面的B超结果出来再进行基因检测,还需要临床医生进一步思考。临床医生需做好遗传咨询工作,和患者明确,有多少疾病是基因检测可以测出来而B超检查不出来的,这样可以为患者争取更多的宝贵时间。

 

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