真核有参转录组测序转录组测序也称为RNA-Seq,能够全面快速地获得某一物种特定组织或细胞在某一状态下转录出来的转录本序列,并与参考基因组比对,获得基因覆盖度和测序饱和度等,分析基因表达水平、差异表达基因、可变剪切、基因融合、基因结构优化、SNP、SSR和预测新转录本等。针对人、小鼠等模式生物,还可进行蛋白互作网络分析,深入研究基因功能,指导网络调控机制的进一步研究。

小标题-产品优势-中
无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测;
可提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围;
可对低起始量或完整度低的样品进行文库构建;
个性化的生物信息解读和分析。

小标题-技术路线-中
2-5-1 真核有参转录组测序-信息分析-附图1 真核有参转录组测序信息分析流程图

小标题-样品要求-中

图标-NGS紫-样品-小
RNA
总量≥2μg
浓度≥100 ng/μl
RIN值≥7.0

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文库
插入片段280bp

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PE150
测序数据量≥6 Gb/样本

小标题-案例分析-中
二代转录组测序助力拟南芥蓝光受体蛋白——隐花色素2的光激发与光钝化机制的研究

隐花色素(Cryptochrome)是一类在生命进化过程中极为保守的蓝光受体蛋白,控制植物的光合作用与生长发育。植物隐花色素蛋白(CRY) 通过其称之为黄素(Flavin)的吸光基团吸收光子以激发原初光反应。激发态隐花色素蛋白通过与其信号蛋白 (CIB1、SPA1、COP1等)的相互作用而调控下游功能基因表达。在本研究中,作者通过RNA-Seq证明了植物隐花色素的光诱导蛋白质二聚化反应为其原初光反应的关键步骤,同时发现了隐花色素的二聚化反应受到两个隐花色素抑制因子(BIC)的调控以决定植物光受体的活性与信号強弱, 进而调控光合作用、光形态建成、以及开花时间等植物生长发育进程。

2-5-1 真核有参转录组测序-案例分析-附图-小

CRY和BIC受蓝光调控的转录组变化图谱

Qin Wang, Zecheng Zuo, Chentao Lin, et al., Photoactivation and inactivation of Arabidopsis cryptochrome 2. PLANT PHOTOBIOLOGY.(2016),VOL 354 ISSUE 6310.