miRNA-Seq MicroRNA(miRNA)是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA,miRNA 是生物体内一类重要的特殊分子,诱导基因沉默,参与细胞生长、发育、基因转录和翻译等诸多生命活动的调控过程。通过高通量测序,可以发掘、鉴定和定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱、挖掘新的miRNA分子、预测靶基因、鉴定样品间差异表达分析。

小标题-产品优势-中
通用性高:可对任意物种、任意大小、已知或未知的Small RNA进行序列测定,无需了解前体序列信息或二级茎环结构信息;
高精确度:有效定量表达水平跨越6个数量级的转录本丰度;
高灵敏度:10M Reads测序量能够检测稀有转录本;
测序平台:一次性可获得数百万条序列。

小标题-技术路线-中
2-5-3 miRNA-Seq-信息分析-附图1 小RNA测序信息分析流程图

小标题-样品要求-中

图标-NGS紫-样品-小
Total RNA
总量≥10μg
浓度≥100 ng/μl
RIN值≥6.0

图标-NGS紫-文库-小
50SE或75SE
10M Reads/样本

图标-NGS紫-测序-小
50SE或75SE
10M Reads/样本

小标题-案例分析-中
小RNA测序研究电子香烟对人类呼吸道上皮细胞中的基因表达的影响

尽管所有形式的烟草暴露对健康都有不良影响,但电子烟暴露(eCig)的重要性尚不完全清楚。本文研究了eCig对人肺上皮细胞miRNA转录组的整体影响。在气液界面分化的原代人支气管上皮(NHBE)细胞暴露于eCig液体。将NHBE暴露于任何eCig液体导致氧化应激反应基因(包括GCLM,GCLC,GPX2,NQO1和HO-1)。 eCig液体中的烟碱的蒸发和/或尼古丁的存在与更大的响应有关。研究人员在NHBE中鉴定了eCig接触失调的578个miRNA,以及受eCig液体汽化影响的125个miRNA,其中eCig蒸气的尼古丁对miRNA表达影响明显。研究人员选择了8个miRNA(29A,140,126,374A,26A-2,147B,941和589)进一步研究。在eCig暴露后,研究人员验证了多种miRNA(包括miR126)的表达增加。研究人员还发现在暴露后两个miR126靶基因MYC和MRGPRX3的表达显着降低。这些数据表明,eCig暴露影响人类肺上皮细胞中的基因表达。

2-5-3 miRNA-Seq-案例分析-附图

eCig处理的NHBE中microRNA表达的全基因组转录分析

SK.Solleti, S.Bhattacharya, TJ.Mariani. et al., MicroRNA expression profiling defines the impact of electronic cigarettes on human airway epithelial cells. Scientific Reports. (2017),7:1081.doi:10.1038/s41598-017-01167-8