动植物全基因组重测序动植物全基因组重测序主要是根据高通量测序技术对生物体不同个体或群体的基因组进行测序,并与已知的参考基因组比对进行差异分析,获得大量遗传变异信息,应用于种群遗传多态性分析、进化分析、挖掘功能基因、指导育种等众多研究领域。

小标题-产品优势-中
除了可以获得基因表达区的信息,还能获得内含子、基因间区域的信息;
可获得SNP、CNV、InDel、SV等变异信息;
能够分析样品基因组中大片段的结构变异和基因组拷贝数变异。

小标题-技术路线-中
2-2 动植物全基因组重测序-信息分析-附图-1

小标题-样品要求-中

图标-NGS紫-样品-小
gDNA
总量≥1.5μg,浓度≥20 ng/μl

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350bp文库

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PE150

小标题-案例分析-中
Illumina二代测序平台完成大豆全基因组重测序

鉴定大豆基因组中受驯化和改良的基因对指导大豆育种具有重要意义。本研究选取来了3类种质品系,总计302例代表性大豆种质资源,使用HiSeq 2500 PE 100测序,测序深度大于11X。研究结果表明大豆在驯化和改良过程中遗传多态性明显降低,暗示大豆具有明显的选择则瓶颈效应;作者对种子大小、种皮颜色、生长习性、油含量等性状做了全基因组关联(GWAS)分析,并找出一系列显著关联位点。

2-2 动植物全基因组重测序-案例分析-附图-小

大豆基因组群体GWAS分析中连锁不平衡(LD)的衰退情况

Zhou Z, Jiang Y, et al., Resequencing 302 wild and cultivated accessions genes related to domestication and improvement in soybean. Nat Biotechnol.(2015),doi:10.1038/nbt.3096.