贝瑞基因董事长高扬:一管血和一管羊水的价值

10月14日,中国医师协会医学遗传医师分会2017年会在长沙召开。来自全国各地的权威医学遗传学专家、临床医师围绕着“医学遗传专科建设与遗传病精准防控”这一主题,以我国医学遗传学建设在出生缺陷防控事业中发挥的重要作用为背景,结合临床实际案例,一同探讨医学遗传学研究的发展趋势与最新进展。本次会议还分别进行了医学遗传医师分会网站、儿童遗传性疾病数据库的启动仪式以及遗传病防控中国行的授旗仪式,共同开启出生缺陷防控事业的新航程。在主会场报告中,贝瑞基因董事长高扬博士通过题为《出生缺陷基因防控技术新进展—— 一管血和一管羊水的价值》的报告,回顾了近年来贝瑞基因以高通量测序技术的临床转化为背景,携手众多医疗机构,一同揭示遗传病发病机制的研究历程,以“最大限度地消除人类致病基因”为使命,深度解析一管血和一管羊水在出生缺陷防控中的临床检测新价值。首先,高扬博士介绍到,贝瑞基因自成立以来,凭借自主研发的核心技术,先后开发了基于高通量测序的贝比安无创DNA产前检测技术、科诺安染色体疾病检测技术、科孕安胚胎植入前遗传学筛查技术以及昂科益肿瘤分子诊断技术,覆盖人类全生命周期的基因检测,如胚胎早期染色体异常检测的PGS、产前检测的NIPT、NIPT-Plus、CNV-Seq、单基因遗传病诊断的全外显子组测序以及肿瘤相关的基因检测产品,真正实现了高通量测序技术在我国临床应用的产品化进程,现已与国内30多个省市自治区超过2000家医院形成共建实验室。

多年来,贝瑞基因锁定出生缺陷二级防控的无创产前检测领域,与湖南省家辉遗传专科医院先后完成了NIPT、NIPT-Plus、NIPT-SGD等技术的联合研发工作。本次报告中高扬博士公布了贝瑞基因与家辉医院共同合作、在全国网络化地推广应用NIPT的74万多份随访统计结果,结果显示贝瑞基因的NIPT检测对三大染色体非整倍体的灵敏度和特异性均超过99%,对T21的的阳性预测值(PPV)高达95%。

在现有文献报道基础上,高扬博士指出,在产前检测中,如仅对染色体数目和大片段的染色体结构异常进行检测,将可能造成20%左右的染色体异常漏诊。值得关注的是,随着NIPT技术临床应用的不断深入,介入性产前诊断数量呈逐渐减少的趋势。

贝瑞基因与家辉医院充分结合产前筛查的发展趋势,通过加深测序深度、加强生物信息学算法的技术攻关,将无创的NIPT检测范围逐步扩大至性染色体异常检测以及常见的严重致病的染色体微重复微缺失综合征的检测。在对6万多份临床样本进行NIPT-Plus检测的随访统计数据分析后发现,其中检出最多的是22q11缺失综合征,其他小于10Mb的致病性微重复微缺失也发现多例,这些异常是传统核型与普通NIPT都难以检出的。目前NIPT-Plus这项检测能对100余种疾病在产前通过孕妇外周血进行无创的筛查,可及早了解胎儿染色体微缺失微重复情况,为胎儿的健康提供更全面、更有效的保障。

随后,高扬博士介绍了贝瑞基因与家辉医院一同开发的无创单基因病检测的技术策略,通过三代测序等技术平台对孕妇外周血白细胞进行检测,对二代测序技术暂无法解决的单基因病携带者筛查,进一步阐明所谓“一管血的价值”。

在谈到“一管羊水的价值”时,高扬博士指出,根据产前诊断机构临床数据显示,目前,NIPT作为一种常见的染色体数目异常产前筛查技术,检测的特异性和准确性高,这使得选择介入性产前诊断的人群对后续检测有较高的期望值。在这种情况下,需要一种无需细胞培养的稳定、快速、通量大、精度高、成本低的检测方法来实现对染色体微重复微缺失的准确诊断,较传统的G显带核型分析技术、芯片技术等介入性诊断技术,基于高通量测序的CNV-Seq技术,可以真正的提升“一管羊水的价值”。

通过多家临床机构临床数据证实,CNV-Seq技术正是一种适用于羊水、脐血、绒毛、流产物、外周血等多种样本,其分析效能优于中密度的芯片。同时,高扬博士分享了来自172家产前诊断机构的1万多例产前诊断CNV-Seq检测随访统计结果,通过这1万多例临床产前诊断样本与核型分析的平行对比发现,CNV-Seq比核型分析多检出289个明确致病的微重复微缺失综合征胎儿;CNV-Seq帮助明确了47例核型分析不能明辨的产前诊断结果;还发现了3例非整倍体嵌合样本。

高扬博士进一步指出,对于CNV-Seq这项全基因组均匀扫描的检测技术而言,难免会遇到与CMA一样的问题——致病性未知变异(VOUS)的检出。对于这些变异,高扬博士认为,要通过贝瑞基因与各临床机构的共同努力,让各机构的临床样本的变异数据、胎儿表型数据变成真正的大数据,在不久的将来用来更好的解读变异片段的致病性。

最后,高扬博士介绍了贝瑞基因正在研发测试的“分子核型”BioNano平台,该平台能直观地对150Kb至1.5Mb的染色体片段进行检测,希望通过该平台应用的研发完善遗传变异检测的产品线,以期更好的实现出生缺陷基因防控技术体系的建设以及临床应用与推广。

 

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