【前沿】cSMART技术在肿瘤诊断的应用前景

来源:肿瘤咨询 

cSMART技术是贝瑞和康公司自主开发的一套测序文库构建技术,能实现对血浆DNA进行单基因突变检测。在CSCO期间,我们有幸采访了来自贝瑞和康公司的周代星博士,就这方面的热点,周博士为我们做了精彩的介绍。

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肿瘤资讯: ctDNA检测是现在液态活检的一个热点,但目前尚没有能够真正大规模用于临床的检测技术,您认为造成这个现象主要有哪些因素?

周代星:我认为对ctDNA的认识还在进行之中,第二个是技术上的敏感度还没有达到。现在渐渐都在得到解决,当然这也涉及到技术的成熟度,就是在今后的几年之内,随着技术的灵敏度越来越高,成熟度越来越好,这个技术进入临床检测的几率越来越大。

 

肿瘤资讯: 目前国内外的ctDNA检测的技术有哪些?它们的实际效果如何?各有什么优缺点?贝瑞研发的cSMART专利技术与其他技术相比有哪些优势?

周代星:国内外的ctDNA可以分成三类技术:一类是基于已有的荧光定量PCR这个技术,但是这个技术主要的问题在于敏感度不够好,差不多只有百分之六十几;第二是Digital PCR技术,这个技术的敏感度可以达到百分之八十几,所以Digital PCR在市场上具有一定的检测可能性,潜力非常非常好,目前还处于应用的初期,还需要很多的临床研究数据来支持;第三类就是 NGS,就是基于高通量测序技术的液态检测的技术,NGS是大家认为最为重要的技术,同Digital PCR相比它能够检测的面比较广,可以测很多基因,多个位点,同时还保留了Digital PCR绝对定量的特点,且它的敏感度也比Digital PCR要高,根据我们的数据,可以达到90%的敏感度,因此NGS是我们认为未来非常重要的方向,可能也是最主要的工具。而NGS和Digital PCR今后能不能相辅相成,我觉得今后也有这种可能性:原因是,Digital PCR的检测时间比较短,NGS目前检测的时间还比较长,那么今后如果NGS还需要较长的检测时间,那么这两者可能就有一个结合的应用。

 

肿瘤资讯: cSMART技术针对ctDNA特点进行了独特的优化,达到了非常高的灵敏度,它目前及将来在临床中能够应用在那些方面?

周代星:我们称为的液态活检是最重要的应用,主要是用在肿瘤上面,在一个肿瘤病人入院的时候,首先的应用就是,如果能获取组织,那么组织检测是目前通常的做法,那么结果就应该很好了。那么当有一大部分人其实得不到组织或者是组织的DNA质量不好,那么这种人就可以用cSMART技术直接进行检测。最起码是一个很好的参考数据。这就是第一个应用,满足目前活检手段上的不足。随着时间的发展和技术的成熟,下一个基于cSMART的应用是基于病人预后上的,也就是说病人已经做了第一次检测,并开始用药,而用药是不是有效,在三个月之后能不能持续,是不是有新的突变出现,尤其抗药突变的出现,就可以用cSMART技术进行跟踪,所谓的Monitoring就是跟踪。所以今后的预后跟踪会成为cSMART技术的一个重要的应用,最后一点就是跟踪多了,病人是不是会复发,也是cSMART技术可以发挥的地方。


周代星 博士

北京贝瑞和康生物技术有限公司CEO,曾任美国illumina公司亚太日本区销售总监,2010年5月回国创立贝瑞和康,专注于高通量测序临床转化项目,致力于人类健康事业。