cSMART携手NIPT,高通量测序应用史上最强组合

贝瑞和康最近发表在《Clinical Chemistry》上最新的一篇文章,文章公布了他们在无创单基因病方面的最新进展——一种被命名为“环化单分子扩增和重测序技术”(Circulating Single-Molecule Amplification and ResequencingTechnology,cSMART)的检测方法。小编凭借在高通量测序领域洞察多年的经验,经过一番梳理和总结,不得不说,这的确是无创产前检测领域的又一重大突破。为什么呢?如下心得与大家分享。

无创产前检测,简单的说,这是一项受益于高通量测序飞速发展和成本不断下降的技术。基于对母体外周血中胎儿胎盘游离DNA的检测,可以准确判读胎儿是否患有21、18、13三体综合征。仅此一项,就几乎重新定义了产前筛查的临床路径。试想,一个强大的技术平台和一种优质的样本碰撞在一起,犹如哈利波特遇见了属于他的魔法棒,那是1+1>2的不可遏制的巨大的期待啊!那么基于cSMART技术的无创产前单基因病检测又是怎么回事?为了方便大家的理解,小编将贝瑞和康的cSMART技术和贝瑞和康自己的NIPT检测技术做了如下比较:

1.NIPT与无创单基因检测相同之处

首先,二者应用领域相同,都是用于产前遗传病检测,目标都是判断胎儿是否患有某种基因或染色体层面的遗传病

其次,二者都只需要抽取孕妇外周血,无需进行羊水穿刺,安全方便

第三,临床流程基本相同,对于孕妇和医生来说都比较简单(孕妇充分知情并同意接受检测-抽取孕妇外周血-血液送检到贝瑞和康-10个工作日出具报告)

第四,选用平台相同,都是采用了NextSeqCN500高通量测序仪。

2.NIPT与无创单基因检测不同之处

第一,检测范围不同。NIPT旨在检测染色体的非整倍体,目前只出具21三体、18三体、13三体综合征的报告;无创单基因检测的目标则在于检测胎儿是否患有可能遗传自父母的重大单基因疾病。

第二,由于其检测范围的不同,适用人群也不同。NIPT更像是普惠大众的技术,由于21、18、13三体综合征属于随机偶发疾病,所以任何希望排查这三大疾病的孕妇,都可以做一个NIPT;而无创单基因检测更具有目的性,一般是已知夫妇双方存在致病型突变或关联的SNPs,通过检测判断胎儿基因型,避免患儿出生。

第三,检测流程迥然不同。NIPT是基于母亲是正常二倍体的前提下,并不区分DNA片段是来源于母亲还是胎儿,只对血浆中游离DNA剂量变化进行判断,推断胎儿是否增加或减少了一条染色体。cSMART技术则不是简单地“数数”,它是一种血浆中断裂DNA捕获技术,通过对捕获到的所有可能的等位基因片段加接头、环化、反向扩增和基于NextSeq cn500的双端测序并进行生物信息学分析,最终从原始血浆样本中计算胎儿突变等位基因的百分比,根据孟德尔遗传定律推演出胎儿基因型。

此外,贝瑞和康专利的NIPT的建库方法不需要进行PCR,直接对血浆来源的DNA进行测序即可,而cSMART技术则用到了环化单分子扩增技术,而这种环化单分子扩增可以最大限度的降低常规PCR反应过程中出现的扩增偏差。

碎碎念了这么多,总的来说:这两种技术和检测同样是不需要进行羊水穿刺的无创检测,通过同样简单的临床路径,在孩子出生前检出是否患有遗传病。

当然,要揽“瓷器活”,就得先有“金刚钻”。显然,贝瑞和康的cSMART技术就是其在未来基因检测领域内大施拳脚的其中一把“金刚钻”。而基于高通量测序平台还会催生出哪些亮瞎人眼的新技术?哈利波特还会用魔法棒给人们带来什么样的奇幻体验?

让我们拭目以待。

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